Tiettyjen kasvien hedelmien sisällä olevia siemeniä kutsutaan siemeniksi; Nämä, jos heille annetaan tarvittava hoito ja ne sijaitsevat niitä suosivassa ympäristössä, voivat itää ja antaa elämän saman lajin kasville. Samalla tavoin tämä termi viittaa niihin asioihin, joita pidetään muiden alku- tai alkupuolena eräänlaisena juurena, varsinkin kun puhutaan tunteista tai aineettomista esineistä. Tätä sanaa käytetään usein siementen synonyyminä. Uskonnossa, tarkemmin sanottuna kristillisessä uskonnossa, peruskäsite mukautetaan tilanteeseen, jossa hyvän ja pahan alkuperää pyritään selvittämään.
Siemenet, sisällä kasvitieteellinen kentässä, ovat sisällä siemeniä. Normaalisti nämä löytyvät hedelmän syvimmästä osasta, jolle he antoivat elämän; esimerkkejä tästä ovat mandariinit, appelsiinit, avokadot ja persikat. Ne voivat itää, niitä säilytetään kompostissa ja ne tarjoavat jatkuvan vesilähteen. Ajan myötä siitä tulee saman lajin tasainen asunto, josta syntyy hedelmä, josta se on peräisin.
Kristillisessä uskonnossa oleva käsite löytyy Vanhasta testamentista, 1.Mooseksen kirjasta. Täällä kaksi siemenet mainitaan: naisen, elämän alkuperää ja Messiaan itsensä (ja siten myös hyvä) ja käärmeen, koska juuri pahan ja vastoinkäymisistä vaivaavia ihminen. Tällaista metaforaa käytettiin ihmiskunnan tuntemaan elämän alkuperä perinteisestä kristillisestä näkökulmasta sen lisäksi, että tehtiin terävä ero hyvän ja pahan välillä kaikkialla esiintyvänä läsnäolona.
