Se on aliatomipartikkeli, jolla on positiivinen alkuaineen varaus, vastapäätä elektronia ja massa 1836 kertaa suurempi. Määrä protoneja on ratkaiseva, jotta voitaisiin määrittää atomien lukumäärä. Protonin elinajanodote on vähintään 10, 35 vuotta, kun otetaan huomioon vakaa hiukkanen; silti jotkut tutkijat sanovat, että päivän päätteeksi se voi hajota muihin hiukkasiin. Sen koostumus koostuu kahdesta ylöspäin kvarkkien ja yksi alas kvarkki, mukaan Kvanttikromodynamiikka.
Sen löysi lähinnä Ernest Rutherford, joka kuvasi ajankohtaa, jolloin alfa-hiukkaset ammuttiin typpikaasulla, tuikeantureissa havaittiin typpisydämen merkkejä, eli ydin koostui protoneista. Alunperin se oli sitä mieltä, että se oli alkeishiukkasten, mutta vuonna 1970 se oli osoitettu, että sille oli hiukkanen koostuu kolmesta alkeis spin hiukkasia. Kun fuusioitunut neutroni, ne tulevat nukleoneista, ja muodostavat ytimen atomeja.
Kun he kokevat suuren ydinvoiman, heitä kutsutaan hadroneiksi, ja näiden luokittelusta niitä kutsutaan baryoneiksi, ja heitä pidetään kevyimpinä. Vaikka on tehty lukuisia testejä, vapaan protonin spontaania hajoamista ei ole vielä havaittu.
Protoni on tunnusomaista, että sen positiivinen varaus, mutta on myös antiproton, joka on antihiukkanen, eli protoni mutta jossa on negatiivinen varaus. Se on hiukkanen, joka on vakaa tyhjiössä eikä hajoaa itsestään. Sen löysivät Kalifornian yliopiston Emilio segre ja Owen Chamberlain vuonna 1955. Törmätessään protoniin niistä tulee mesoneja, ja näiden hiukkasten elämä on hyvin lyhyt.
