Etymologisesti sana antigeeni on kreikkalaista alkuperää. Etuliite "anti", joka tarkoittaa päinvastaista, ja "geno", joka viittaa generointiin. Antigeeni on aine, joka kehoon tullessaan saa sen vasta-aineita taistelemaan sitä vastaan. Esimerkki: virukset, sienet, loiset jne. Antigeenit ovat melkein aina vieraita ja myrkyllisiä hiukkasia, jotka tullessaan kehoon välittömästi sitoutuvat tiettyyn vasta-aineeseen, tällä vasta-aineella on kyky tuhota se.
On olemassa muita mielipiteitä siitä, mitä antigeeni voi olla, sanotaan, että se on asiantuntija molekyyli sisään aiheuttaen vasteen immuunijärjestelmän aktivoitumisen kautta lymfosyyttien, nämä ovat yleisesti proteiinin alkuperää, vaikka ne voivat olla myös hiilihydraatteja. Antigeenien luokittelemiseksi meidän on tiedettävä niiden luonne, kun olemme määrittäneet niiden alkuperän, voimme luokitella ne seuraavalla tavalla. Eksogeeniset antigeenit ovat niitä, jotka kehoon ulkopuolelta, esimerkiksi kautta injektion, inhalaation kautta tai saanti.
Endogeeniset antigeenit ovat niitä, jotka on tuotettu keskellä solun johtuen virus- ja bakteeri-infektioita, kun tämä antigeeni on läsnä solun sisällä on tunnustettava lymfosyytit aktivoituvat ja alkoi erittämään toksiinia ajan menetys tartunnan saaneen solun kuolema. Autoantigeenit ovat niitä, jotka immuunijärjestelmä tunnistaa ja joita esiintyy usein potilailla, jotka kärsivät jonkin tyyppisestä autoimmuunisairaudesta. Kasvaimen antigeenejä ovat ne, jotka sijaitsevat pinnalla kasvaimia.
